上海single cell 单细胞多组学测序

对于稀有样本，或细胞量比较少的稀有组织，样本中每一粒细胞都很珍贵，BD Rhapsody单细胞捕获平台对该种类型的样本能实现友好包容，如果在实际实验中，我们发现因为样本类型和制备单细胞悬液方法的不同，容易出现单细胞悬液中死亡细胞的比例较高的情况。也会和您探讨是否考虑去除单细胞悬液中的死细胞和其他污染物的操作，以获得高质量数据是至关重要的。这是因为，死亡的细胞易裂解导致其中的RNA释放出来。这种cell-free RNA会导致检测的背景噪声，并会影响单细胞数据的质量。因此当样本活性较差时，对细胞悬液中细胞活性检测后，需要进行一般死细胞去除的工作（一般悬液活性小于70%时考虑此操作），以保证较高的上机捕获细胞的质量。烈冰生物作为BD 中国联合成立单细胞测序实验室，为推动单细胞测序技术发展贡献中国力量。上海single cell 单细胞多组学测序

由于高通量测序实验方法相关的测序成本，使得单细胞实验往往非常昂贵，烈冰生物BD Rhapsody单细胞测序服务珍视您的每一份样本，在平台搭建前，我们测试评估了BD Rhapsody的性能，与BD官方公布的数据结合来看，将人293T和小鼠NIH/3T3细胞的1:1混合物以不同浓度上样到BD Rhapsody卡式芯片上。存储的cDNA分子普遍扩增并进行低通量测序（每个细胞月8700个读数）。在测序数据中检测到1109个细胞的上样条件下，每个细胞中，来自每个细胞的平均99.4%的分子经检测为人或小鼠，这表明微孔之间的串扰非常小，在测序数据中检测到1000个或更少细胞的上样密度下，多重态发生率接近零，并且在15000个细胞下小于5%。四川BD单细胞平台单细胞测序技术的迅速发展和应用推广，为从多维度揭示疾病发展提供了强有力的工具。

烈冰生物搭建近10台BD Rhapsody平台，目前为全国范围内的高校、医院和研究所等单位的科研学者提供服务，BD Rhapsody平台采用U型微孔板，1个板即对应1个样本（不混样的情况下），每个通道一般捕获细胞数在1000-10000个之间，而上限可捕获40000细胞时也能获得较低的双细胞率，此外，单个细胞捕获效率高达80%，可准确鉴别稀有细胞类型，有利于稀有样本或小细胞量类型样本研究；细胞可适性高，对细胞大小（直径超过40um细胞需要制备成细胞核）及类型无限制。细胞捕获周期较短，能够实现自动分离，且实验端捕获细胞过程全程可视化进行，保障每一例珍贵样本实验的成功进行，1天内可完成从细胞悬液到cDNA文库构建的所有的测序准备工作。

您的珍贵样本，可以放心依赖烈冰生物BD Rhapsody单细胞捕获系统，首先，该系统的技术原理是基于cyto-seq的微孔技术，因此不会因为样本细胞体积太大或悬液背景太杂等问题导致捕获通道的堵塞进而导致样本的损失；其次，BD RhapsodyTM单细胞捕获系统无电子元件，便于携带，当您的样本需及时实验时，我们可以“拎包上门”，快速的完成细胞捕获部分，不至于珍贵样本因细胞活性快速下降带来的损失；在这，BD Rhapsody单细胞捕获系统对细胞数量包容性较好，细胞悬液上样量高达575ul，针对样本中细胞数量较少的组织类型，也能完成整个项目的细胞捕获工作。丰富的测序和数据分析经验，烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。

什么时候要用到去死细胞的操作呢？跟进烈冰生物多年单细胞测序服务经验来看，当细胞悬液进行质量和活性检测后，考虑对细胞活性在50%-70%的悬液进行去除死细胞的操作。而太低活性的悬液（小于30%），悬液中细胞大量死亡，可能已经丢失了原组织内的细胞比例和状态，失真严重，建议重新收集样本进行新的实验，保证数据的高质量和实验结果的准确性。但需要注意到，去除死细胞的操作会损失一定的细胞数量，因此希望您在提供样本时，尽可能提供足量的细胞，以备实验过程中可能存在的细胞死亡的问题，BD Rhapsody单细胞捕获平台对样本起始细胞量的要求较低，一般提供10万个细胞以上均可满足需求，特殊样本可详细咨询烈冰生物。烈冰对于一个细胞群体中的每个细胞单独进行建库测序分析。湖北BD单细胞实验服务

烈冰生物全国五大实验中心，多地部署BD Rahpsody平台，助您的样本更快速抵达“战场”。上海single cell 单细胞多组学测序

针对单细胞测序的细胞上样数，为什么不建议捕获到的细胞数量越高越好？一味地追求高数量的细胞捕获可能会存在一些问题。例如在上机细胞悬液浓度固定时，如果目标细胞捕获数增加到8000甚至10000，上样细胞悬液体积势必增加，在细胞悬液质量不是很理想（细胞活性<90%、碎片率>5%、结团率均>5%）的情况下，引入的背景信号会增加，分析结果不理想的直接体现包括：cell、non-cell无法有效区分和Fraction reads in cells偏低。当cell和non-cell无法有效区分时，会使得数据出现假阳性和假阴性结果！当目标细胞捕获数很大时，多细胞率会增加，数据分析时，此部分“cell”表现为基因检测数和UMI检测数是正常cell的N倍（N是一个GEM包裹的细胞数），导致所有细胞的统计数据（单个细胞基因检测中位数、单个细胞UMI检测中位数）虚高。此部分“cell”虽然可以通过设置数据分析阈值进行过滤，但是容易会有此类数据的残留和正常高基因检测细胞的人为去除！上海single cell 单细胞多组学测序

上海烈冰生物医药科技有限公司一直专注于生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询，市场营销策划，市场信息咨询与调查（不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验），从事货物及技术的进出口业务，计算机、软件及耗材（除专控），软件开发【依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动】，是一家医药健康的企业，拥有自己**的技术体系。目前我公司在职员工以90后为主，是一个有活力有能力有创新精神的团队。公司业务范围主要包括：单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨，深受客户好评。公司凭着雄厚的技术力量、饱满的工作态度、扎实的工作作风、良好的职业道德，树立了良好的单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序形象，赢得了社会各界的信任和认可。