无锡single cell 单细胞多组学测序

据不完全统计，截至2022年6月，烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇，从平台应用比例来看，应用10X Genomics和BD Rhapsody两大平台发文比例各占50%左右，研究类型涵盖疾病发展，靶点探索，免疫研究，神经发育，干细胞分化，植物发育，退行病变，糖尿病，COVID-19等等研究；从发表期刊水平来看，烈冰生物联合发表的单细胞文章，CNS一区期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,风湿类领域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Science多篇，IF大于10分以上文章占比高达68.5%，烈冰专属单细胞测序服务团队，将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。BD平台基于cyto-seq技术，实现细胞和磁珠的一对一结合。无锡single cell 单细胞多组学测序

现有的单细胞测序技术阵营在几个主要领域存在差别。一个是基于微流控通道的细胞与Beads的在通道内的动态结合，通过油相水相不相容的特点将结合了的细胞和Beads进行分隔，在这个空间，单个细胞的内容物释放，转录本或其他生物分析物被标记或添加索引，以便下游识别。BD Rhapsody单细胞测序平台采用静态微孔技术（Cyto-Seq具有类似的技术原理）。通过微孔板的物理分隔，将一个个单个细胞和带有标签的磁珠，一对一的“框”在微反应的物理平台中。这样，每一个细胞都会结合一个磁珠，那么在每一个磁珠中上长满了不同的Cell Barcode和UMI Barcode连接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，这个抓手就会使用oligo dT抓住mRNA构建文库。苏州BD单细胞测序服务公司烈冰单细胞多组学测序助您探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台，针对庞大的单细胞测序数据，能够实现细胞类型鉴定的快、精、准：一键导入gene list构建个性化基因列表；轻松一点即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型；一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图：轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图，还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析，节省工作时间并提升整体工作效率。烈冰生物全国五大实验中心，多地部署BD Rahpsody平台，助您的样本更快速抵达“战场”。

烈冰生物为您的实验定制工作流程： 对于不同用户和实验，单细胞实验工作流程往往需要不同程度的样本操作、质量和通量。BD仪器选项可以根据具体需求进行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分选平台（如 BD FACSMelody），是上游样本富集的良好选择。此外，我们具备BD Rhapsody单细胞成像仪提供自动化细胞计数和细胞样本活性测试，帮助用户制备适用于Cartridge微孔板单细胞捕获浓度的样本。扫描仪提供了微孔板上磁珠捕获细胞的计数。BD Rhapsody 样品上样工作站轻巧便携，可在实验室内轻松移动。搭配烈冰倾情研发多年的成果NovelBrain生物信息大数据分析系统，完成测序数据的生物信息分析和结果可视化呈现。这些工具包括 UMI 分析算法和可视化工具，即使没有经验的用户也可分析和理解单细胞数据。单个细胞的基因结构和基因表达状态，并鉴定细胞的类型。广州BD VDJ单细胞测序服务

测序的革新让科学研究从个体基因差异逐渐转为个体细胞的基因差异。无锡single cell 单细胞多组学测序

多样本数据合并：Fraction of Reads Kept：合并样本时，各样本根据Mapped Barcoded Reads per Cell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大，需要进行Downsample处理，以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平，从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深度解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！无锡single cell 单细胞多组学测序

上海烈冰生物医药科技有限公司总部位于江月路999号奇亚特中心22幢，是一家生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询，市场营销策划，市场信息咨询与调查（不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验），从事货物及技术的进出口业务，计算机、软件及耗材（除专控），软件开发【依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司。烈冰生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队，以高度的专注和执着为客户提供单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序。烈冰生物继续坚定不移地走高质量发展道路，既要实现基本面稳定增长，又要聚焦关键领域，实现转型再突破。烈冰生物始终关注医药健康市场，以敏锐的市场洞察力，实现与客户的成长共赢。